Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc18a3O35304 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms