Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm8888J3QPX5 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
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