Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gm2035J3QP87 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gm2035J3QP87 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gm2035J3QP87 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2035J3QP87 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms