Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M1F7CXU4 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms