Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm8005F6YKY3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms