Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
R3hdm1E9Q9Q2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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