Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm20518E9Q548 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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