Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc8E9PWG2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms