Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Clip3B9EHT4 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms