Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rrn3B2RS91 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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