Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms