Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Pm20d2A3KG59 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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Pm20d2A3KG59 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Pm20d2A3KG59 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Pm20d2A3KG59 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Pm20d2A3KG59 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Pm20d2A3KG59 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Pm20d2A3KG59 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Pm20d2A3KG59 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Pm20d2A3KG59 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Pm20d2A3KG59 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Pm20d2A3KG59 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Pm20d2A3KG59 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Pm20d2A3KG59 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Pm20d2A3KG59 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pm20d2A3KG59 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Pm20d2A3KG59 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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