Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf39A2RT81 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf39A2RT81 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf39A2RT81 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf39A2RT81 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf39A2RT81 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf39A2RT81 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf39A2RT81 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf39A2RT81 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf39A2RT81 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf39A2RT81 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Rnf39A2RT81 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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Rnf39A2RT81 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Rnf39A2RT81 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Rnf39A2RT81 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf39A2RT81 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf39A2RT81 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf39A2RT81 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Rnf39A2RT81 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Rnf39A2RT81 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf39A2RT81 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf39A2RT81 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf39A2RT81 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf39A2RT81 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Rnf39A2RT81 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Rnf39A2RT81 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf39A2RT81 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf39A2RT81 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Rnf39A2RT81 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Rnf39A2RT81 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf39A2RT81 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf39A2RT81 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Rnf39A2RT81 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf39A2RT81 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rnf39A2RT81 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf39A2RT81 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf39A2RT81 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf39A2RT81 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf39A2RT81 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf39A2RT81 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf39A2RT81 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf39A2RT81 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf39A2RT81 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf39A2RT81 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf39A2RT81 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf39A2RT81 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf39A2RT81 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rnf39A2RT81 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms