Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ilf3Q9Z1X4 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms