Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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