Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tomm40Q9QYA2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms