Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Rabgef1Q9JM13 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rabgef1Q9JM13 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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