Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Kcnn1Q9EQR3 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Kcnn1Q9EQR3 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Kcnn1Q9EQR3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Kcnn1Q9EQR3 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Kcnn1Q9EQR3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Kcnn1Q9EQR3 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 Gm8051-201ENSMUST00000120464 466 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
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Kcnn1Q9EQR3 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 D830005E20Rik-202ENSMUST00000219691 971 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnn1Q9EQR3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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