Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Rnf6Q9DBU5 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Rnf6Q9DBU5 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Rnf6Q9DBU5 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Rnf6Q9DBU5 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Rnf6Q9DBU5 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Rnf6Q9DBU5 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Rnf6Q9DBU5 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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