Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms