Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms