Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Jam3Q9D8B7 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Jam3Q9D8B7 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms