Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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