Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgms2Q9D4B1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms