Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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