Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K7

UPF0687 protein C20orf27 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1K7 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D1K7 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D1K7 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.6 ms