Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Sgo1Q9CXH7 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Sgo1Q9CXH7 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Sgo1Q9CXH7 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Sgo1Q9CXH7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Sgo1Q9CXH7 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Sgo1Q9CXH7 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Sgo1Q9CXH7 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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