Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Xrcc3Q9CXE6 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Xrcc3Q9CXE6 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Xrcc3Q9CXE6 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xrcc3Q9CXE6 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xrcc3Q9CXE6 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xrcc3Q9CXE6 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xrcc3Q9CXE6 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xrcc3Q9CXE6 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xrcc3Q9CXE6 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xrcc3Q9CXE6 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xrcc3Q9CXE6 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xrcc3Q9CXE6 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xrcc3Q9CXE6 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xrcc3Q9CXE6 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xrcc3Q9CXE6 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xrcc3Q9CXE6 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xrcc3Q9CXE6 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xrcc3Q9CXE6 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Xrcc3Q9CXE6 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Xrcc3Q9CXE6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xrcc3Q9CXE6 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Xrcc3Q9CXE6 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xrcc3Q9CXE6 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xrcc3Q9CXE6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xrcc3Q9CXE6 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Xrcc3Q9CXE6 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xrcc3Q9CXE6 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xrcc3Q9CXE6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Xrcc3Q9CXE6 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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