Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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