Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ly6kQ9CWP4 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.6 ms