Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnaseh2cQ9CQ18 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnaseh2cQ9CQ18 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms