Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim3Q99PE5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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