Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NsmfQ99NF2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms