Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl43Q99N89 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms