Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdac9Q99N13 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Hdac9Q99N13 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Hdac9Q99N13 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Hdac9Q99N13 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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