Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp1b4Q99ME6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms