Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp16Q99LG0 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms