Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ciao1Q99KN2 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ciao1Q99KN2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ciao1Q99KN2 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ciao1Q99KN2 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ciao1Q99KN2 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ciao1Q99KN2 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ciao1Q99KN2 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ciao1Q99KN2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ciao1Q99KN2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Ciao1Q99KN2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ciao1Q99KN2 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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