Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ddb2Q99J79 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms