Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Rnf144aQ925F3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Rnf144aQ925F3 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Rnf144aQ925F3 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Rnf144aQ925F3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rnf144aQ925F3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rnf144aQ925F3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rnf144aQ925F3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rnf144aQ925F3 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rnf144aQ925F3 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Rnf144aQ925F3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf144aQ925F3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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