Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc8Q8VD72 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Ttc8Q8VD72 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Ttc8Q8VD72 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Ttc8Q8VD72 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Ttc8Q8VD72 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Ttc8Q8VD72 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Ttc8Q8VD72 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Ttc8Q8VD72 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Ttc8Q8VD72 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Ttc8Q8VD72 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Ttc8Q8VD72 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Ttc8Q8VD72 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc8Q8VD72 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms