Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

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Length 584 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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OptnQ8K3K8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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OptnQ8K3K8 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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OptnQ8K3K8 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OptnQ8K3K8 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms