Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SrrdQ8K2M3 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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