Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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