Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc38Q8CDN8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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