Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q8C708 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q8C708 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms