Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx17Q8BVL3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms