Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnrc6bQ8BKI2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms