Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Atg4bQ8BGE6 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Atg4bQ8BGE6 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Atg4bQ8BGE6 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Atg4bQ8BGE6 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Atg4bQ8BGE6 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Atg4bQ8BGE6 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Atg4bQ8BGE6 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Atg4bQ8BGE6 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4bQ8BGE6 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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