Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Ttc28Q80XJ3 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Ttc28Q80XJ3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Ttc28Q80XJ3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Ttc28Q80XJ3 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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Ttc28Q80XJ3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Ttc28Q80XJ3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Ttc28Q80XJ3 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ttc28Q80XJ3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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